Yamaha sugli scudi nelle prove libere del Gp della Malesia. Miglior tempo di Colin Edwards seguito da Valentino Rossi, ma la seconda sessione di prove libere a Sepang era stata praticamente dominata da Shinya Nakano (San Carlo Honda Gresini Team) fino agli ultimissimi secondi. In chiusura la zampata vincente di Edwards, seguito poi da Rossi e da Stoner, con il giapponese che alla fine si è ritrovato al quarto posto in un attimo.